組織

総務部
本会の庶務全般、事業の企画・立案・調査、各部の調整と事業の円滑化、他団体との連携、その他各部に属しない事業に関すること。
団体競技部
各競技の選手養成と強化、各競技審判員の養成、全京都障害者総合スポーツ大会の開催、全国身体障害者スポーツ大会選手選考・強化、全国車いす駅伝競走大会選手選考・強化、全国知的障害者スポーツ大会選手選考・強化、各種スポーツ大会の参加選手及びチームの状態把握に関すること。
個人競技部
団体競技部に同じ
普及部
府民の障害者スポーツ意識の高揚を図り、障害者スポーツを振興。「障害者スポーツのつどい」の普及振興と指導者派遣、「障害者シンクロナイズドスイミング」の普及振興に関すること。
研修登録部
障害者スポーツに関する研修の計画と実施、京都府及び京都市の障害者スポーツ指導者養成事業、会員（コーチ・ボランティア）の登録、日本身体障害者スポーツ協会公認身体障害者スポーツ指導者の登録に関すること。
研究開発部
障害者スポーツの振興に関わる科学的研究、新種目及びルールの研究、障害者スポーツ施設・用具の調査研究に関すること。
広報部
会報「つどい」発行、京都新聞「ハンディ通信」の記事協力、その他の広報活動。
管理部
競技用具の管理、整備・充実に関すること。